ชีวสารสนเทศด้านการเกษตรและพืช

การวิเคราะห์เชิงคำนวณของจีโนม ทรานสคริปโทม และเมแทบอโลมของพืช เพื่อสนับสนุนการปรับปรุงพันธุ์พืช ความทนทานต่อสภาวะเครียด และการศึกษาด้านสารพฤกษเคมีและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ

ภาพรวม

ชีวสารสนเทศด้านการเกษตรและพืชประยุกต์ใช้วิธีการคำนวณทางคอมพิวเตอร์เพื่อทำความเข้าใจชีววิทยาของพืชในระดับโมเลกุล สนับสนุนการพัฒนาสายพันธุ์พืชให้มีผลผลิตสูงและทนทานยิ่งขึ้น รวมถึงการค้นพบสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพจากพืช

หัวข้อหลัก

การประกอบจีโนม การวิเคราะห์ระบุตำแหน่งหน้าที่ยีน (annotation) และแพนจีโนมิกส์ (pan-genomics) ของพืชผล
ทรานสคริปโทมิกส์การตอบสนองต่อสภาวะเครียด (ภัยแล้ง ความเค็ม ความร้อน)
การวิเคราะห์โปรไฟล์ของสารพฤกษเคมี (phytonutrient profiling) และเมแทบอไลต์ทุติยภูมิ (secondary metabolites)
การออกแบบเป้าหมายการแก้ไขจีโมโนม (genome editing) ด้วยระบบ CRISPR-Cas
การวิเคราะห์หาตำแหน่งลักษณะเชิงปริมาณ (QTL mapping)
การดัดแปลงพันธุวิศวกรรมของไซยาโนแบคทีเรียเพื่อผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพจากพืช