สาขาวิจัย
12 สาขาวิจัยหลักที่ขับเคลื่อนนวัตกรรมด้านชีวสารสนเทศและชีววิทยาเชิงคอมพิวเตอร์
สาขาวิจัยหลัก
หลักสูตรผสานความเชี่ยวชาญด้านการคำนวณและชีววิทยาใน 12 สาขาวิจัยเฉพาะทาง เพื่อให้นิสิตสามารถทำวิจัยในสาขาที่ตนสนใจ
การค้นพบยาและเภสัชพันธุศาสตร์
วิธีการจำลองทางคอมพิวเตอร์ (in silico) เพื่อระบุ คัดกรอง และพัฒนาปรับปรุงประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ทางยา รวมถึงการคัดกรองเสมือนจริง (virtual screening) แบบจำลอง QSAR และเภสัชพันธุศาสตร์ (pharmacogenomics)
การเรียนรู้ของเครื่องและปัญญาประดิษฐ์ในชีววิทยา
การประยุกต์ใช้การเรียนรู้เชิงลึก (deep learning) เครือข่ายประสาทเทียม แบบจำลองกราฟ และปัญญาประดิษฐ์ (AI) เพื่อทำนายคุณสมบัติทางชีววิทยา จำแนกประเภทโรค และการวิเคราะห์หาความสัมพันธ์ในข้อมูลโอมิกส์ (omics)
การวิเคราะห์เชิงวิวัฒนาการและสายวิวัฒนาการ
การวิเคราะห์เพื่อหาความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการด้วยการคำนวณ ผ่านการศึกษาความหลากหลายทางชาติพันธุ์เชิงโมเลกุล (molecular phylogenetics) จีโนมิกส์เชิงวิวัฒนาการ (phylogenomics) และวิวัฒนาการระดับโมเลกุล (molecular evolution)
การวิเคราะห์ลำดับและจีโนมิกส์
แนวทางการวิเคราะห์เชิงคำนวณที่ครอบคลุมสำหรับข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ DNA, RNA และโปรตีน รวมถึงการหาลำดับเบสของทั้งจีโนม (whole-genome sequencing) การวิเคราะห์หาตำแหน่งแปรปรวน (variant calling) และจีโนมิกส์เปรียบเทียบ (comparative genomics)
ชีววิทยาระบบและเครือข่าย
การสร้างแบบจำลองทางคณิตศาสตร์และคอมพิวเตอร์ของเครือข่ายระดับชีวโมเลกุล เพื่อทำความเข้าใจพฤติกรรมของเซลล์ที่ซับซ้อนและพฤติกรรมเชิงระบบที่อุบัติขึ้นใหม่ (emergent properties)
ชีวสารสนเทศเชิงโครงสร้าง
การทำนาย การวิเคราะห์ และการสร้างแบบจำลองสามมิติของโครงสร้างโปรตีนและ RNA เพื่อทำความเข้าใจหน้าที่การทำงานของโมเลกุล อันตรกิริยาระหว่างโมเลกุล (molecular interactions) และโครงสร้างเป้าหมายทางยา
ชีวสารสนเทศด้านการเกษตรและพืช
การวิเคราะห์เชิงคำนวณของจีโนม ทรานสคริปโทม และเมแทบอโลมของพืช เพื่อสนับสนุนการปรับปรุงพันธุ์พืช ความทนทานต่อสภาวะเครียด และการศึกษาด้านสารพฤกษเคมีและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ
ชีวสารสนเทศทางการแพทย์และคลินิก
การประยุกต์ใช้ชีวสารสนเทศศาสตร์ในจีโนมิกส์ทางคลินิก การวินิจฉัยกลุ่มโรคหายาก การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (genome-wide association studies) และการแพทย์เฉพาะบุคคล (personalized medicine)
ทรานสคริปโทมิกส์และการแสดงออกของยีน
การวิเคราะห์เชิงคำนวณของข้อมูล RNA sequencing เพื่อหาปริมาณการแสดงออกของยีน การระบุยีนที่มีระดับการแสดงออกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ (differentially expressed genes) และการศึกษาคุณลักษณะของทรานสคริปโทม
โปรตีโอมิกส์และเมตาบอโลมิกส์
แนวทางการวิเคราะห์เชิงคำนวณด้วยเทคนิคเมสสเปกโทรเมตรี (mass spectrometry) เพื่อระบุ บ่งชี้ปริมาณ และวิเคราะห์การทำงานในระดับขนาดใหญ่ (large-scale) ของโปรตีนและเมแทบอไลต์
ไมโครไบโอมและเมตาจีโนมิกส์
การวิเคราะห์องค์ประกอบของไมโครไบโอม (microbiome) และข้อมูลเมตาจีโนมิกส์จากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมหรือทางคลินิก โดยใช้การวิเคราะห์โปรไฟล์ของ 16S rRNA และการหาลำดับนิวคลีโอไทด์แบบ whole-metagenome shotgun
โอมิกส์เซลล์เดี่ยวและการบูรณาการหลายโอมิกส์
วิธีการทางคอมพิวเตอร์เพื่อวิเคราะห์ข้อมูล single-cell RNA sequencing และบูรณาการข้อมูลหลายโอมิกส์ (multi-omics) เพื่อจำแนกความแตกต่างและศึกษาความหลากหลายของกลุ่มเซลล์ (cellular heterogeneity) การระบุชนิดของเซลล์ (cell types) และการศึกษาวิถีพัฒนาการของเซลล์ (developmental trajectories)
การประยุกต์ใช้งานวิจัย
สาขาวิจัยเหล่านี้สร้างผลกระทบจริงใน 5 ด้านหลัก