โปรตีโอมิกส์และเมตาบอโลมิกส์

แนวทางการวิเคราะห์เชิงคำนวณด้วยเทคนิคเมสสเปกโทรเมตรี (mass spectrometry) เพื่อระบุ บ่งชี้ปริมาณ และวิเคราะห์การทำงานในระดับขนาดใหญ่ (large-scale) ของโปรตีนและเมแทบอไลต์

ภาพรวม

โปรตีโอมิกส์และเมแทบอโลมิกส์ทำงานร่วมกันเพื่อเป็นส่วนเติมเต็มของจีโนมิกส์ โดยมุ่งเน้นการตรวจวัดโมเลกุลที่ทำหน้าที่ชีวภาพในเซลล์โดยตรง การวิเคราะห์เชิงคำนวณของข้อมูลเมสสเปกโทรเมตรี (mass spectrometry) ช่วยระบุชนิดและบ่งชี้ปริมาณของโปรตีนและเมแทบอไลต์หลายพันชนิดพร้อมกัน

หัวข้อหลัก

การค้นหาฐานข้อมูลและการถอดลำดับกรดอะมิโนของเพปไทด์แบบ de novo (de novo peptide sequencing)
การวิเคราะห์วัดปริมาณแบบไม่มีตัวบ่งชี้ (label-free) และแบบระบุไอโซโทป (isotope-labeled)
การวิเคราะห์กระบวนการดัดแปลงโปรตีนหลังการแปลรหัส (post-translational modification: PTM)
การระบุชนิดของเมแทบอไลต์และการวิเคราะห์วิถีชีวเคมี (pathway mapping)
การบูรณาการข้อมูลหลายโอมิกส์ (multi-omics integration)
งานโครงสร้างโปรตีโอมิกส์ (structural proteomics) โดยเทคนิค cross-linking MS