ชีวสารสนเทศเชิงโครงสร้าง

ภาพรวม

ชีวสารสนเทศเชิงโครงสร้างทำหน้าที่ผสานเครื่องมือเชิงคำนวณเข้ากับวิชาชีววิทยาโมเลกุล เพื่อทำความเข้าใจพฤติกรรมโครงสร้างสามมิติของสารชีวโมเลกุลขนาดใหญ่ (biomacromolecules) ที่ส่งผลต่อการทำหน้าที่ทางชีวภาพ

หัวข้อหลัก

• การทำนายโครงสร้างโปรตีน (Homology modeling, AlphaFold)
• การจำลองพลศาสตร์ระดับโมเลกุล (molecular dynamics simulation)
• การวิเคราะห์การจับกันของโปรตีน-ลิแกนด์ และโปรตีน-โปรตีน (molecular docking)
• การทำนายโครงสร้าง RNA
• การจำลองโครงสร้างแบบหยาบ (coarse-grained) และระดับอะตอมทั้งหมด (all-atom)
• การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและหน้าที่ (structure-function relationship)

การประยุกต์ใช้

• การระบุโครงสร้างเป้าหมายทางยา
• การศึกษาการทำงานของโปรตีนช่องไอออน (ion channels)
• วิศวกรรมเอนไซม์ (enzyme engineering)
• การออกแบบและพัฒนาวัคซีน