ชีววิทยาระบบและเครือข่าย

การสร้างแบบจำลองทางคณิตศาสตร์และคอมพิวเตอร์ของเครือข่ายระดับชีวโมเลกุล เพื่อทำความเข้าใจพฤติกรรมของเซลล์ที่ซับซ้อนและพฤติกรรมเชิงระบบที่อุบัติขึ้นใหม่ (emergent properties)

ชีววิทยาระบบและเครือข่าย

ภาพรวม

ชีววิทยาระบบบูรณาการข้อมูลเชิงทดลองและแบบจำลองการคำนวณเพื่อวิเคราะห์อันตรกิริยาของส่วนประกอบชีวภาพในระดับระบบ การวิเคราะห์โครงสร้างเครือข่ายชีวภาพช่วยเผยความเชื่อมโยงเชิงหน้าที่การทำงานของยีน โปรตีน และเมแทบอไลต์

หัวข้อหลัก

  • การสร้างแบบจำลองเครือข่ายการควบคุมยีน (gene regulatory networks)
  • เครือข่ายอันตรกิริยาระหว่างโปรตีนกับโปรตีน (protein-protein interaction network: PPI)
  • การวิเคราะห์ดุลยภาพของฟลักซ์เมแทบอลิก (flux balance analysis: FBA)
  • การสร้างแบบจำลองวิถีการส่งสัญญาณภายในเซลล์ (signaling pathway modeling)
  • โทโพโลยีเครือข่ายและการวิเคราะห์ฮับยีน (hub gene analysis)
  • การบูรณาการข้อมูลหลายโอมิกส์ (multi-omics integration)

การประยุกต์ใช้

  • การระบุเป้าหมายยาในเครือข่ายเชื่อมโยงโรค
  • วิศวกรรมเมแทบอลิก (metabolic engineering)
  • การศึกษาและวิเคราะห์กลไกการดื้อยาปฏิชีวนะ
  • การค้นพบตัวบ่งชี้ชีวภาพในระดับระบบ (system-level biomarkers)