ชีววิทยาระบบและเครือข่าย
การสร้างแบบจำลองทางคณิตศาสตร์และคอมพิวเตอร์ของเครือข่ายระดับชีวโมเลกุล เพื่อทำความเข้าใจพฤติกรรมของเซลล์ที่ซับซ้อนและพฤติกรรมเชิงระบบที่อุบัติขึ้นใหม่ (emergent properties)
ภาพรวม
ชีววิทยาระบบบูรณาการข้อมูลเชิงทดลองและแบบจำลองการคำนวณเพื่อวิเคราะห์อันตรกิริยาของส่วนประกอบชีวภาพในระดับระบบ การวิเคราะห์โครงสร้างเครือข่ายชีวภาพช่วยเผยความเชื่อมโยงเชิงหน้าที่การทำงานของยีน โปรตีน และเมแทบอไลต์
หัวข้อหลัก
- การสร้างแบบจำลองเครือข่ายการควบคุมยีน (gene regulatory networks)
- เครือข่ายอันตรกิริยาระหว่างโปรตีนกับโปรตีน (protein-protein interaction network: PPI)
- การวิเคราะห์ดุลยภาพของฟลักซ์เมแทบอลิก (flux balance analysis: FBA)
- การสร้างแบบจำลองวิถีการส่งสัญญาณภายในเซลล์ (signaling pathway modeling)
- โทโพโลยีเครือข่ายและการวิเคราะห์ฮับยีน (hub gene analysis)
- การบูรณาการข้อมูลหลายโอมิกส์ (multi-omics integration)
การประยุกต์ใช้
- การระบุเป้าหมายยาในเครือข่ายเชื่อมโยงโรค
- วิศวกรรมเมแทบอลิก (metabolic engineering)
- การศึกษาและวิเคราะห์กลไกการดื้อยาปฏิชีวนะ
- การค้นพบตัวบ่งชี้ชีวภาพในระดับระบบ (system-level biomarkers)
อาจารย์ในสาขาวิจัยนี้ (5)
รองศาสตราจารย์
ดร.กิติพร พลายมาศ
ภาควิชาคณิตศาสตร์และวิทยาการคอมพิวเตอร์ คณะวิทยาศาสตร์
ผู้ช่วยศาสตราจารย์
ดร.ชมพูนิกข์ กาญจนพังคะ
ภาควิชาจุลชีววิทยา คณะวิทยาศาสตร์
รองศาสตราจารย์
ดร.ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ
ภาควิชาคณิตศาสตร์และวิทยาการคอมพิวเตอร์ คณะวิทยาศาสตร์
ผู้ช่วยศาสตราจารย์
ดร.เทวฤทธิ์ สะระชนะ
ภาควิชาเคมีคลินิก คณะสหเวชศาสตร์
ศาสตราจารย์
ดร.สัญชัย พยุงภร
ภาควิชาชีวเคมี คณะแพทยศาสตร์