ทรานสคริปโทมิกส์และการแสดงออกของยีน

การวิเคราะห์เชิงคำนวณของข้อมูล RNA sequencing เพื่อหาปริมาณการแสดงออกของยีน การระบุยีนที่มีระดับการแสดงออกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ (differentially expressed genes) และการศึกษาคุณลักษณะของทรานสคริปโทม

ภาพรวม

ทรานสคริปโทมิกส์นำเสนอภาพรวมของยีนที่มีการถอดรหัสในเซลล์หรือเนื้อเยื่อใดเนื้อเยื่อหนึ่ง ณ ช่วงเวลาที่กำหนด การวิเคราะห์เชิงคำนวณของข้อมูล RNA-seq ช่วยระบุรูปแบบการทำงาน กลไกการควบคุม และการเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของยีนในสภาวะการเกิดโรค

หัวข้อหลัก

การวิเคราะห์ข้อมูล bulk RNA-seq และการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ (differential expression analysis)
การวิเคราะห์กระบวนการตัดต่อทางเลือกของอาร์เอ็นเอ (alternative splicing)
การวิเคราะห์ลักษณะและหน้าที่ของ lncRNA (long non-coding RNA)
การวิเคราะห์การปรับแต่งโมเลกุล RNA (RNA modification เช่น m6A ด้วยเทคโนโลยี Nanopore)
การคัดกรองเชิงหน้าที่ของยีนด้วยระบบ CRISPR ร่วมกับวิเคราะห์ระดับทรานสคริปโทม (CRISPR screen with transcriptomic readout)
การหาลำดับอาร์เอ็นเอโดยตรงด้วยเทคโนโลยี Oxford Nanopore direct RNA sequencing