สาขาวิจัยหลัก

สาขาวิจัยที่สนใจ

• คณิตศาสตร์ประยุกต์และการสร้างแบบจำลองทางคณิตศาสตร์
• ชีวสารสนเทศศาสตร์และชีววิทยาเชิงคำนวณ
• วิทยาการข้อมูลและการเรียนรู้ของเครื่อง
• การวิเคราะห์กราฟและเครือข่าย
• ชีววิทยาเชิงระบบ การวิเคราะห์สมดุลฟลักซ์ และแบบจำลองเมแทบอลิซึมระดับจีโนม

ภาพรวมงานวิจัย

งานวิจัยมุ่งพัฒนาแนวทางเชิงคำนวณที่บูรณาการชีวสารสนเทศศาสตร์ ชีววิทยาเชิงระบบ การสร้างแบบจำลองทางคณิตศาสตร์ และปัญญาประดิษฐ์ เพื่อทำความเข้าใจระบบชีวภาพที่ซับซ้อนจากข้อมูลชีวภาพขนาดใหญ่ โดยผสานข้อมูลจีโนมิกส์ ทรานสคริปโตมิกส์ ข้อมูลระดับเซลล์เดี่ยว เครือข่ายชีวภาพ และแบบจำลองเมแทบอลิซึมระดับจีโนม เพื่อศึกษากลไกระดับโมเลกุลของการทำงานของเซลล์ การเกิดโรค และการตอบสนองของสิ่งมีชีวิตต่อสภาวะแวดล้อม หนึ่งในหัวข้อวิจัยหลักคือการพัฒนาแบบจำลองเมแทบอลิซึมระดับจีโนม (Genome-scale Metabolic Models; GEMs) และวิธีการวิเคราะห์เชิงข้อจำกัด เช่น Flux Balance Analysis (FBA) และ Flux Variability Analysis (FVA) รวมถึงการบูรณาการข้อมูลการแสดงออกของยีนเข้าสู่แบบจำลองเมแทบอลิซึม โดยมีผลงานเด่น ได้แก่ ICON-GEMs และ IGM ซึ่งประยุกต์ใช้กับจุลชีพ พืช และระบบชีวภาพที่หลากหลาย นอกจากนี้ งานวิจัยยังมุ่งพัฒนาแนวทางด้านการแพทย์แม่นยำและเวชศาสตร์เครือข่าย โดยบูรณาการข้อมูล transcriptomics, single-cell sequencing, GWAS, เครือข่ายโปรตีน และการเรียนรู้ของเครื่อง เพื่อค้นหากลไกของโรค ชีวเครื่องหมาย เป้าหมายการรักษา และการนำยาเดิมมาใช้ใหม่ งานวิจัยครอบคลุมโรคมะเร็ง โรคเม็ดเลือดขาว CLL, Richter transformation, Primary Sclerosing Cholangitis (PSC) รวมถึงชีววิทยาเชิงระบบของพืช โดยเฉพาะการศึกษาข้าว การตอบสนองต่อความเครียด และการควบคุมเมแทบอลิซึม เพื่อสนับสนุนการแพทย์ การเกษตร และเทคโนโลยีชีวภาพอย่างยั่งยืน